Исследования по классическому исламу являются непременной  составляющей всех программ и проектов, связанных с изучением истории и культуры мусульманского мира.

В исследовательскую программу Фонда Марджани «Классическое исламское наследие» входят следующие направления: переводы и публикация восточных исторических источников и памятников средневековой исламской мысли; переиздание классических европейских и восточных монографий по исламской тематике и подготовка оригинальных исследований по проблемам классического исламского наследия.

Отдельным долговременным мегапроектом является создание электронной базы источников по исламу. Работы, подготовленные в рамках программы, публикуются Издательским домом Марджани в серии Bibliotheca Islamica.